Von 1994 – 1999 studierte Juergen Rustler Architektur und Design an der Staatlichen Akademie der Bildenden Künste in Stuttgart. Im Anschluss an das Studium wurde ihm auf Vorschlag von Prof. David Chipperfield das Heinrich-Tessenow verliehen. Von 2000 – 2010 arbeitete Juergen Rustler bei Prof. Volker Staab im Architekturbüro Staab Architekten in Berlin. Als Projektleiter hat er u.a. den Umbau, die Erweiterung und Gesamtsanierung des denkmalgeschützten Museums Albertinum in Dresden, sowie den Umbau und die Sanierung des Ostflügels der Alten Pinakothek in München verantwortlich geleitet. 2009 gründete Juergen Rustler sein eigenes Architekturbüro und 2016 gründete er gemeinsam mit der Architektin Pia Maier Schriever das Büro Rustler Schriever Architekten in Berlin.

Von 2015 – 2017 lehrte Juergen Rustler im Masterstudiengang Monumental Heritage an der Hochschule Anhalt in Dessau und 2016 an der China Academy of Art Hangzhou China. 2017 wurde er zum Professor für „Entwerfen und Bestand“ an der Hochschule Mainz ernannt.